About

高橋一樹

Education

2021-2024 Tokyo Institute of Technology (doctor of science)

2020-2021 Tokyo Institute of Technology (master of science)

2018-2020 Tokyo Institute of Technology (bachelor of science)

2013-2018 National Institute of Technology, Oyama college

Career

2024.10- Postdoctoral Fellow ― Waseda Universitty ( Hosokawa laboratory)

Fellowship

2021-2024 JST-SPRING program

Keyword

Endosymbiosis, Genome evolution, Gut microbiome

Publication

• Nishimura, M., Takahashi, K., Hosokawa, M. (2025). Recent Advances in Single-Cell RNA Sequencing of Bacteria: Techniques, Challenges, and Applications. Journal of Bioscience and Bioengineering, In Press.
• Inagaki, T., Igai, K., Takahashi, K., Hongoh, Y. (2024). Transmission dynamics of symbiotic protist communities in the termite gut: association with host adult eclosion and dispersal. Royal Society Open Science, 11(5), 231527.
• Takahashi, K., Kuwahara, H., Horikawa, Y., Izawa, K., Kato, D., Inagaki, T., Yuki, M., Ohkuma, M., Hongoh, Y. (2023). Emergence of putative energy parasites within Clostridia revealed by genome analysis of a novel endosymbiotic clade. The ISME Journal, 17(11), 1895-1906.
• Suzuki, T., Fukaya, M., Takahashi, K., Takeuchi, M., Hara, R., Ogawa, J., Ueda, M. (2020). Cloning and characterization of a recombinant α-glucosidase from Ensifer adhaerens NBRC 100388 and evaluation of its glucosyl transfer activity. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 30, 101837.
• Takeuchi, M., Kuwahara, H., Murakami, T., Takahashi, K., Kajitani, R., Toyoda, A., Itoh, T., Ohkuma, M., Hongoh, Y. (2020). Parallel reductive genome evolution in Desulfovibrio ectosymbionts independently acquired by Trichonympha protists in the termite gut. The ISME journal, 14, 2288–2301.
• Takahashi, K., Terauchi, I., Ono, M., Satoh, H., Ueda, M. (2018). Microbial production of neryl-α-D-glucopyranoside from nerol by Agrobacterium sp. M-12 reflects glucosyl transfer activity. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 82(12), 2205-2211.

Presentations

International

• Takahashi, K., Kuwahara, H., Horikawa, Y., Izawa, K., Kato, D., Yuki, M., Ohkuma, M., and Hongoh, Y., Discovery and evolution of obligately-intracellular parasites belonging to the class Clostridia, The 13th Asian Symposium for Microbial Ecology, Hamamatsu (Japan). Nov 2023.
• Kong Suet Kei, Igai, K., Takahashi, K., Murooka, S., Kuwahara, H., Sato, T., Ohkuma, M., Hongoh, Y., Ecology and physiology of endonuclear alphaproteobacterial symbionts (order Holosporales) infecting termite gut protists, The 13th Asian Symposium for Microbial Ecology, Hamamatsu (Japan). Nov 2023.
• Takahashi, K., Kuwahara, H., Horikawa, Y., Inagaki, T., Izawa, K., Yuki, M., Ohkuma, M., and Hongoh, Y., Genome analysis of a novel endosymbiotic clade in Clostridia suggests the emergence of energy parasites within the predominant bacterial class in animal intestines, 10th Congress of the International Symbiosis Society, Lyon (France). Jul 2022.
• Inagaki, T., Igai, K., Takahashi, K., and Hongoh, Y., Dynamics of gut microbiota in termite associated with host’s adult eclosion and dispersal, 10th Congress of the International Symbiosis Society, Lyon (France). Jul 2022.
• Inagaki, T., Igai, K., Takahashi, K., and Hongoh, Y., Dynamics of gut microbiota in termite during caste differentiation and vertical transmission. International Union for the Study of Social Insects (IUSSI2022), San Diego (US). Jul 2022.

Conferences in Japan

• 板垣優大, 高橋一樹, 雪真弘, 清水美智留, 村上匠, 大熊盛也, 本郷裕一., シロアリ腸内で優占するBetaproteobacteria綱細菌の1細胞ゲノム解析, 日本微生物生態学会第36回浜松大会, 浜松, 2023年11月.（ポスター）
• 杉山奈緒, 高橋一樹, 関謙二郎, 堀川雄太郎, 佐藤朋之, 桑原宏和, 村上匠, 大熊盛也, 本郷裕一., シロアリ腸内原生生物細胞共生Mycoplasmatota門細菌の生態とゲノム解析, 日本微生物生態学会第36回浜松大会, 浜松, 2023年11月.（ポスター）
• 大須賀奨, 高橋一樹, 猪飼桂, 雪真弘, 清水美智留, 桑原宏和, 村上匠, 大熊盛也, 本郷裕一., シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するPlanctomycetota門細菌の発見とゲノム解析, 日本微生物生態学会第36回浜松大会, 浜松, 2023年11月.（ポスター）
• 齋藤崇登, 室岡聡, 猪飼桂, 高橋一樹, 佐藤朋之, 大熊盛也, 本郷裕一., 他細菌種に特異的に付着共生するAlphaproteobacteriaの形態とゲノム解析, 日本微生物生態学会第36回浜松大会, 浜松, 2023年11月.（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 稲垣辰哉, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一., 細胞内寄生性クロストリディア綱細菌の発見と寄生体進化プロセスの解明, 日本進化学会第25回沖縄大会, 沖縄, 2023年9月.（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 稲垣辰哉, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一., 細胞内寄生性Clostridia綱細菌の発見と進化過程の考察, 第96回細菌学会, 姫路, 2023年3月.（口頭）
• 稲垣辰哉, 猪飼桂, 高橋一樹, 本郷裕一., 成虫脱皮及び分散過程におけるシロアリ腸内原生生物群集の伝播ダイナミクス, 第67回日本応用動物昆虫学会, 大阪, 2023年3月.（口頭）
• 小林京平, 桑原宏和, 猪飼桂, 高橋一樹, 稲垣辰哉, 吉岡拓哉, 大熊盛也, 本郷裕一., シロアリ腸内原生生物Stephanonympha細胞に共生する多様な細菌系統の局在と機能予測, 日本微生物生態学会第35回大会, 北海道, 2022年9月.（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 稲垣辰哉, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一., 細胞内寄生性Clostridia綱細菌の発見と進化プロセスの考察, 第16回細菌学若手コロッセウム, 北海道, 2022年8月.（口頭・ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一. 細胞内寄生性Clostridiales目細菌の生存戦略と進化プロセス, 共生生物学会 第5回大会, オンライン, 2021年11月（口頭）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一. シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するClostridiales目細菌の機能と進化, 日本微生物生態学会第34回大会, オンライン, 2021年10月（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一. シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するClostridiales目細菌の比較ゲノム解析, 第15回日本ゲノム微生物学会年会, オンライン, 2021年3月（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一. シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するClostridiales目細菌の発見とゲノム解析, 第14回日本ゲノム微生物学会年会, 名古屋, 2020年3月（ポスター）
• 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 大熊盛也, 本郷裕一. シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するClostridiales目細菌の発見, 日本共生生物学会 第3回大会, 横浜, 2019年11月（ポスター）

Award

• 優秀若手発表賞, 日本共生生物学会第5回大会, 2021年11月
• Rising to the Challenge Award, 36th JSME Annual Meeting & 13th ASME, 2023年11月